通常医院做试管婴儿一般来说，并不能确定是男孩子还是女孩子，做第三代试管可以选择性别，有一个前提条件，那就是有一定要选择性别的病征。如今种植前遗传学确诊和判断的研究可对胚胎进行性别确诊和判断，是通过特殊的方法对试管婴儿后4-10细胞阶段的胚胎活检1-2个细胞进行分析。关键是用在防止性连锁遗传病的患儿妊娠，防止了高危夫妻在发现胎儿异常后终止妊娠的痛苦。如无医学指征的性别确诊和判断，医院是不能实施该技术的。

但这种技术仅限于有遗传性疾病，比如有连锁性遗传病的夫妻们，为了优生，对他们精、卵形成的胚胎，在放人子宫前，在已经形成的胚胎中选择一个细胞进行基因和染色体检查。假使遗传性疾病与性别有关，如血友病、男性发病，女性为携带者，对于女性朋友们本身来说，是不会发病的，那就要进行胚胎的性别筛选，防止病儿出生。做检查方面的工作的话，比较复杂，成本高。而且如今，用PGD技术可以检出的疾病很有限，所以要严格选择病例。假使仅仅为了生男孩或女孩则完全没有必要做这项检查。很多中心多年的分娩资料显示，男性和女性的比例几乎是1：1，所以试管婴儿技术决不能随意用来进行性别选择。