大多数研究发现，与卵裂期胚胎移植相比，囊胚移植后的单卵双胞胎发生率明显更高。有人推测是由于体外培养时间或培养基的差异造成的。卵裂期与囊胚不同阶段的培养液中葡萄糖水平有差异，囊胚培养液中糖水平要高，直接导致胚胎发生“应激反应”，导致囊胚内细胞团分裂，内细胞团将来发育成胎儿，如分裂成两个，则发育成两个胎儿。也有人推测培养液中的生长因子与单卵双胎有关，低浓度的生长因子可能导致代谢应激，导致细胞凋亡或细胞粘附力减弱，胚胎容易“被动”分开成为两个。