6aa囊胚和4aa囊胚的质量都算是比较好，但是也有试管成功率、培养时间、发育程度的差异。不过这两种囊胚都是质量比较好的胚胎，4AA囊胚着床率在60%左右，6AA移植成功率则只有50%左右。其实这两种囊胚不能直接做比较，因为必须要在同一时间、同一天的囊胚才可以进行比较，这种比较方法也是更加科学的。
首先，从试管成功率来看，4aa较好，4aa已经进入到扩张囊胚的阶段，内细胞团分级较高，细胞数目多、排列比较紧密，质量好，移植成功率也较高，而6aa的囊胚发育过于成熟，移植过程中容易出现损坏，所以移植成功率会比4aa低。
其次，4AA囊胚着床率在60%左右，6AA移植成功率则只有50%左右，发育程度4AA的囊胚发育的速度也更加快，6AA的囊胚发育速度慢一些，而且在实际的操作过程中6AA的囊胚也更容易损坏，降低了其移植的成功率。
最后，4aa囊胚和6aa囊胚区别不仅仅是移植成功率不同，还有质量和等级上的不同，不过这两种囊胚都是质量比较好的胚胎。
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