试管胚胎发育三天和五天的区别很多，从时间和成功率等等都不同。另外五天囊胚在成功率上通常高于三天鲜胚。主要是因为五天囊胚经历了更长时间的体外培养，具备更高的发育潜力、更多的细胞数量和复杂的细胞层结构、以及更广泛的基因表达。然而，选择哪种胚胎并不是绝对的，每个女性的具体情况都是不一样的。
1、发育时间不同：第三天胚胎是体外培养胚胎三天后移植，而五天胚胎是体外培养胚胎到五天后再移植。
2、着床时间不同：由于胚胎移植的时间不同，其本身着床时间也会有差异。若是三天胚胎一般着床时间较早。而五天胚胎由于时间较为滞后，着床时间也会比较晚。
3、着床成功率不同：三天胚胎虽有较多的优质胚胎，但选择程度较低，此时着床成功率相对也比较低。而五天胚胎由于选择程度较高，趋近于正常妊娠，此时着床概率较高。
4、风险不同：三天胚胎由于体外培养的时间较短，此时胚胎以及孕妇个体所具备的风险相对比较高。而五天胚胎经由筛选后，可较为有效地降低妊娠风险，促进胚胎正常发育，减少对孕妇的影响。
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