三代试管可以筛查复合杂合基因，但尽管三代试管技术在单基因遗传病的筛查方面取得了一定进展，但在复合杂合的筛查方面仍存在一定的局限性。也就是说，三代试管筛查染色体的准确率只有60%-70%，并不能够达到100%。
三代试管可以筛查复合杂合基因，在遗传学检测阶段，医生会利用最新的高通量测序技术对受精卵中的DNA 进行全面分析。通过比对双方父母的DNA信息以及相应数据库中的遗传信息，可以确定受精卵是否携带复合杂合基因。
但是对于复合杂合，即同时携带两种或更多种基因突变的情况，三代试管技术的准确性和可行性存在一些局限性。复合杂合的筛查不仅涉及多种基因的检测，还需要考虑不同基因之间的相互作用及其对个体的影响，这增加了筛查的难度。
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