试管婴儿出现先天性畸形是不能完全避免的，但是可以做第三代试管婴儿减少畸形概率。本身先天性畸形最大的问题就是遗传、药物、辐射等原因，不可能完全避免，但是可以借助相应的设备和技术，尽量减少出现畸形的可能性。
1、遗传因素。试管婴儿技术可能会选择父母可能存在遗传性疾病的受精卵，从而增加先天性畸形的风险。
2、药物因素。在进行试管婴儿过程中，医生会给受精卵进行激素治疗，这些激素可能会对胚胎的发育产生不良影响，从而增加先天性畸形的风险。
3、辐射因素。在试管婴儿技术的过程中，医生会使用X光机来检查胚胎的发育情况，如果暴露时间过长，可能会对胚胎的发育产生不良影响，从而增加先天性畸形的风险。
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